پس از تاسیس دانشگاه گیلان در سال ۵۵-۱۳۵۴ ، تحصیلات تکمیلی فعالیتهای آموزشی خود را ازبهمن ماه ۱۳۶۹با پذیرش ۶ دانشجو در رشته ریاضی محض در مقطع کارشناسی ارشد آغاز نمود.به تدریج با پذیرش دانشجوی کارشناسی ارشد در رشته های شیمی ، فیزیک ، مهندسی مکانیک ، زبان و ادبیات فارسی و... و نیز با پذیرش ۳ دانشجوی دکتری رشته شیمی برای اولین بار در سال ۱۳۷۸ و پس از آن پذیرش در رشته های ریاضی ،مهندسی مکانیک و ... تحصیلات تکمیلی روند رو به گسترشی داشته است.

در حال حاضر دانشگاه در 94 رشته - گرایش در مقطع کارشناسی ارشد و 49رشته در مقطع دکتری تخصصی دانشجو می پذیرد.

مديران تحصيلات تکميلی دانشگاه از زمان راه اندازی اين دوره تا کنون عبارتند از :

۱- آقای دکتر سيد علی الهی نيا          عضو هيات علمی گروه گياهپزشکی                             سال ۱۳۷۲

۲- آقای دکتر پيروز عزيزی                    عضو هيات علمی گروه خاکشناسی                                   ۷۵-۷۲

۳- آقای دکتر محمدرضا بهرام پرور        عضو هيات علمی گروه مهندسی برق                                  ۷۷-۷۵

۴- آقای دکتر محمدعلی زنجانچی        عضو هيات علمی گروه شيمی                                          ۸۶-۷۷

۵- آقای دکتر فرهاد شيرينی               عضو هيات علمی گروه شيمی                                           ...-۸۶

شرح وظایف دفتر تحصیلات تکمیلی :

۱- ثبت نام از دانشجویان ارشد و دکتری

۲- اعلام مغایرتهای شناسنامه ای و معدل به سازمان سنجش و ...

۳- درخواست تائیدیه تحصیلی و ریزنمرات مقاطع تحصیلی قبلی دانشجویان جدیدالورود ، بررسی آنها و ارسال ریزنمرات به دانشکده ها

۴- انجام امور مربوط به دانشجویان متقاضی انتقال،مهمان اعم از آماده کردن موارد جهت ارسال به کمیسیون موارد خاص،اعلام به دانشگاههای مبدا یا مقصد و دریافت یا ارسال مدارک ثبت نامی و سوابق تحصیلی به آن دانشگاهها

۵- اعلام ظرفیت درخواستی رشته ها برای پذیرش دانشجو از طریق آزمون های سراسری به سازمان سنجش

۶- بررسی پایان نامه ها و پرونده های فارغ التحصیلی و ارجاع پرونده ها به اداره فارغ التحصیلان

۷- اعلام تغییرات مربوط به پایان نامه های مصوب

۸- ارسال آگهی پذیرش دانشجو از طریق سهمیه استعدادهای درخشان سایر دانشگاهها به دانشکده ها

۹- تحويل کارت دائم دانشجويی به دانشجويان کارشناسی ارشد و دکتری

10-  هماهنگی در برگزاری مصاحبه آزمون دکتری و اعلام نتایج نهایی به سازمان سنجش

11- صدور گواهی اشتغال به تحصيل و گواهی رتبه برای دانشجويان دکتری

12- بررسی تقاضای متقاضیان انتقال از دانشگاههای خارج از کشور به دانشگاه گیلان در مقاطع تحصیلات تکمیلی

13- دريافت صلاحيت عمومی پذیرفته شدگان بدون کنکور(دانشجویان انتقال به اداخل ، استعداد درخشان و ..)

14 بررسی درخواست تمديد سنوات نيمسال ششم دانشجويان

۱5- ارسال عناوين مصوب پروپوزالهای دانشجويان به حوزه معاونت پژوهشی و اداری و مالی دانشگاه

۱6- صدور گواهی انجام دفاع برای دانشجويان کارشناسی ارشد و دکتری

۱7- آماده کردن دستور کار جلسات شورای تحصيلات تکميلی دانشگاه و تنظیم صورتجلسات مربوطه

۱8- ارسال مصوبات شورای تحصيلات تکميلی دانشگاه به دانشکده ها

19- تهيه خلاصه وضعيت متقاضی دانشجويان  تمديد سنوات، لغو حکم اخراج و...، ارسال آنها به کميسيون موارد خاص دانشگاه، دريافت مصوبات و ابلاغ به دانشکده ها

20- بررسی درخواستهای متعدد دانشجويان و اقدامات لازم جهت رفع مشکلات آنان

فهرست رشته های دایر در مقطع کارشناسی ارشد:

دانشکده علوم ریاضی:

ریاضی محض، ریاضی کاربردی، آمار ریاضی

دانشکده علوم پایه:

شیمی فیزیک ، شیمی آلی ، شیمی معدنی ، شیمی تجزیه ، شیمی کاربردی، فیزیک- حالت جامد ، فیزیک بنیادی(نظری) ، فیزیک هسته ای ، فوتونیک ، زیست شناسی - بیوشیمی ، زیست دریا - جانوران دریا، زیست شناسی - علوم گیاهی(سیستماتیک اکولوژی) ، زیست شناسی - علوم گیاهی( فیزیولوژی گیاهی)، زیست شناسی - علوم جانوری(سلولی تکوینی) ، زیست شناسی-علوم جانوری (زمینه جانور شناسی)، زیست شناسی-ژنتیک

دانشکده تربیت بدنی

تربیت بدنی - فیزیولوژی ورزشی ، تربیت بدنی- مدیریت ورزشی ، تربیت بدنی -حرکات اصلاحی و آسیب شناسی ورزشی

دانشکده علوم انسانی 

زبان و ادبیات فارسی،علوم اجتماعی- جامعه شناسی،روانشناسی عمومی،مدیریت صنعتی،مدیریت بازرگانی، آموزش زبان انگلیسی، زبان و ادبیات انگلیسی، حقوق خصوصی، حقوق جزا و جرم شناسی، روابط بین الملل، جغرافیا و برنامه ریزی شهری، زبان و ادبیات عرب

دانشکده فنی 

 مهندسی برق - الکترونیک ، مهندسی برق-قدرت، مهندسی برق-مخابرات(میدان)، مهندسی برق مخابرات(سیستم)، مهندسی مکانیک - طراحی کاربردی ، مهندسی مکانیک - تبدیل انرژی ، مهندسی نساجی - شیمی نساجی و علوم الیاف ، مهندسی عمران - سازه ، مهندسی عمران - مکانیک خاک و پی ، مهندسی عمران - راه و ترابری، مهندسی عمران-سازه های دریایی، مهندسی شیمی، مهندسی کامپیوتر-نرم افزار

دانشکده کشاورزی 

 مهندسی کشاورزی - اصلاح نباتات ، مهندسی کشاورزی - زراعت ، مهندسی کشاورزی - علوم باغبانی (میوه کاری) ،مهندسی کشاورزی - علوم باغبانی (سبزی کاری) ، مهندسی کشاورزی - علوم باغبانی (گیاهان زینتی) ، مهندسی کشاورزی - خاکشناسی (شیمی و حاصلخیزی خاک)، مهندسی کشاورزی - علوم خاک ( پیدایش،رده بندی وارزیابی خاک) ، مهندسی کشاورزی - خاکشناسی ( فیزیک و حفاظت خاک)، مهندسی کشاورزی - علوم دامی (تغذیه دام) ، مهندسی کشاورزی - علوم دامی (اصلاح نژاد دام) ، مهندسی کشاورزی - علوم دامی (فیزیولوژی دام) ، مهندسی کشاورزی - حشره شناسی کشاورزی ، مهندسی کشاورزی - بیماری شناسی گیاهی ، مهندسی کشاورزی - بیوتکنولوژی در کشاورزی ، مهندسی کشاورزی - توسعه روستایی ، مهندسی کشاورزی-آبیاری و زهکشی

دانشکده منابع طبیعی 

مهندسی منابع طبیعی - جنگلداری ، مهندسی منابع طبیعی - جنگل شناسی و اکولوژی جنگل، مهندسی جنگل، مهندسی منابع طبیعی- بوم شناسی آبزیان شیلاتی، مهندسی منابع طبیعی -تکثیر و پرورش آبزیان

دانشکده معماری و هنر

مهندسی معماری- موسیقی-گرافیک

پژوهشکده گیلان شناسی:

ایران شناسی-فرهنگ، آداب و رسوم و میراث فرهنگی، ایران شناسی-تاریخ

پردیس بین الملل

مهندسی معماری، مهندسی عمران - سازه، مهندسی عمران - مکانیک خاک و پی،مدیریت MBA - مدیریت مالی،مدیریت MBA - مدیریت بازاریابی، حسابداری، حقوق خصوصی، حقوق بین الملل، مهندسی فناوری اطلاعات ،علوم سیاسی، روابط بین الملل، آموزش زبان انگلیسی، زیست شناسی - ژنتیک، زیست شناسی - علوم سلولی مولکولی، مهندسی مکانیک - طراحی کاربردی، مهندسی مکانیک - تبدیل انرژی، طراحی شهری،مهندسی کشاورزی - علوم باغبانی،مهندسی کشاورزی - بیوتکنولوژی کشاورزی، مهندسی فضای سبز،ریاضی کاربردی،شیمی تجزیه، شیمی آلی

فهرست رشته های تحصیلی دایر دوره دکتری :

دانشکده علوم انسانی: زبان و ادبیات فارسی

دانشکده تربیت بدنی :تربیت بدنی - فیزیولوژی ورزشی ، تربیت بدنی- مدیریت و برنامه ریزی در تربیت بدنی

دانشکده علوم پایه: شیمی محض - فیزیک ، شیمی محض - آلی ، شیمی محض - معدنی ، شیمی محض - تجزیه ، شیمی پلیمر،  فیزیک حالت جامد ، فیزیک نظری ، فیزیک هسته ای ، فیزیک لیزر، بیوشیمی

دانشکده علوم ریاضی:ریاضی-ریاضی محض، ریاضی محض- گروهها، ریاضی محض- آنالیز ، ریاضی محض- آنالیز تابعی، ریاضی محض-  آنالیز هارمونیک، ریاضی - جبر، ریاضی محض - گروههای تولوژیک، ریاضی محض - سیستمهای دینامیکی، ریاضی محض- معادلات دیفرانسیل، ریاضی محض - نظریه ،معادلات دیفرانسیل با مشتقات جزیی، ریاضی محض- نظریه احتمال، ریاضی-ریاضی کاربردی، ریاضی کاربردی - آنالیز عددی، ریاضی کاربردی - روشهای عددی در جبر خطی، ریاضی کاربردی -حل عددی معادلات تابعی، ریاضی کاربردی- فرایندهای تصادفی، ریاضی کاربردی - مسائل مقدار مرزی

دانشکده فنی: مهندسی مکانیک - طراحی کاربردی، مهندسی مکانیک-تبدیل انرژی، مهندسی نساجی-شیمی نساجی و علوم الیاف، مهندسی عمران-سازه، مهندسی عمران-مکانیک خاک و پی

دانشکده کشاورزی :مهندسی کشاورزی - علوم باغبانی (میوه کاری) ،مهندسی کشاورزی - علوم باغبانی (سبزی کاری) ، مهندسی کشاورزی - علوم باغبانی (گیاهان زینتی)، مهندسی کشاورزی - بیماری شناسی گیاهی-قارچ شناسی، مهندسی کشاورزی-حشره شناسی کشاورزی، مهندسی کشاورزی -  علوم دامی- اصلاح نژاد دام، مهندسی کشاورزی -  علوم دامی- تغذیه دام، مهندسی کشاورزی -  علوم دامی- فیزیولوژی دام، مهندسی کشاورزی- زراعت، مهندسی کشاورزی- اصلاح نباتات، بیوتکنولوژی کشاورزی- گیاهی

دانشکده منابع طبیعی:علوم جنگل-جنگلداری

پریس بین الملل: مهندسی کشاورزی-علوم باغبانی-گیاهان دارویی و معطر