Ali Aalami

Journal Paper

1. "Identification of drought‑tolerant hub genes in Iranian KC‑2226 genotype of Aegilops tauschii using transcriptomic analysis"
   1- کیوان حسن پور 2- علی اعلمی 3- رقیه قنبری 4- رامین حسینی 5- شهرام نعیمی 6- کیوان اسماعیل زاده
   Scientific Reports, 2023
2. "A universal protocol for high-quality DNA and RNA isolation from diverse plant species"
   1- فرهاد معصومی 2- لیلا جباری 3- رضا خیام نکویی 4- علی اعلمی 5- برایان ات ول 6- پائول هی نس
   PLoS One, 2023
3. "Expression profling of yield related genes in rice cultivars under terminal drought stress"
   1- محجوبه اسماعیل زاده مریدانی 2- مسعود اصفهانی 3- علی اعلمی 4- علی مومنی 5- محمد رضا خالديان 6- مریم حسینی چالشتری
   MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, 2023
4. "A Comprehensive Meta-analysis to Identify the Responsive Genes in Sorghum Under Salinity and Drought Stresses"
   1- حسین کاظمی 2- عاطفه صبوری 3- علی اعلمی 4- امین عابدی
   JOURNAL OF PLANT GROWTH REGULATION, 2023
5. "Effect of Different Treatments on Dormancy Breaking for Seed Germination Enhancement and Metabolite Analysis of Capparis spinosa L."
   1- احمد نوروزیان 2- علی اعلمی
   journal of medicinal plants and by-products, 2023
6. "Computational prediction of protein–protein interactions’ network in Arabidopsis thaliana"
   1- ژاله حکمتی 2- جواد ظهیری 3- علی اعلمی
   ACTA PHYSIOLOGIAE PLANTARUM, 2023
7. "Genome‑wide survey of catalase genes in Brassica rapa, Brassica oleracea, and Brassica napus: identification, characterization, molecular evolution, and expression profiling of BnCATs in response to salt and cadmium stress"
   1- منور کنعانی سرچشمه 2- امین عابدی 3- علی اعلمی
   PROTOPLASMA, 2022
8. "Evaluation of root yield and morphological traits of 15 accessions and cultivars of chicory (Cichorium intybus L.) in the plains of the north of Iran"
   1- صادق پورمرادی 2- علی اعلمی 3- مسعود اصفهانی
   -, 2021
9. "Population genetics and gene sequence analysis of Athelia rolfsii collected from Northern Iran"
   1- زهرا مهری 2- سيد اکبر خداپرست 3- علی اعلمی 4- صدیقه موسی نژاد 5- حسین مسیگل 6- هانس-پیتر گروسارت
   Mycologia Iranica, 2021
10. "Allometric relationships and growth indices analysis in aerobic, upland, and lowland rice (Oryza sativa L.) genotypes"
    1- محجوبه اسماعیل زاده مریدانی 2- مسعود اصفهانی 3- علی اعلمی 4- علی مومنی 5- محمد رضا خالديان
    -, 2021
11. "Achene micromorphology of the genus Potentilla L. (Rosaceae) in Iran and its systematic application"
    1- سمیرا صادقی 2- مرضيه بيگم فقير 3- فریده عطار 4- علی اعلمی
    Turkish Journal of Botany, 2021
12. "Identification of Genes and Molecular Markers Associated with Germination Components in F9 Lines of Rice under Osmotic Stress"
    1- عباس صابري 2- عاطفه صبوری 3- امین عابدی 4- علی اعلمی 5- تيمور رضوي پور
    Plant Genetic Researches, 2021
13. "Genetic diversity of Aegilops tauschii accessions and its relationship with tetraploid and hexaploid wheat using retrotransposon‑based molecular markers"
    1- سمیرا صفی یار 2- علی اعلمی 3- بابک عبدالهی 4- بابک ربيعی 5- مجتبی کرد رستمی
    CEREAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 2021
14. "Effect of drought stress on some morphological and physiological traits in Aegilops tauschii genotypes"
    1- کیوان حسن پور 2- علی اعلمی 3- رامین حسینی 4- شهرام نعیمی
    Iranian Journal of Genetics and Plant Breeding, 2021
15. "Profiling the physiological response of upland and lowland rice (Oryza sativa L.) genotypes to water deficit"
    1- محجوبه اسماعیل زاده 2- مسعود اصفهانی 3- علی اعلمی 4- علی مومنی 5- محمد رضا خالديان
    Journal of Crop Science and Biotechnology, 2021
16. "Evaluation of Genetic Diversity in Some Lettuce Lines According to the Morphological and Phonological Characteristics"
    1- محمدرضا رضایی 2- يوسف حميداوغلی 3- جمالعلی الفتی 4- علی اعلمی 5- عبدالکریم ذاکری
    -, 2021
17. "Effect of Nutrition Management and Application of Zeolite on Fertilizer Use Efficiency and Water Productivity in Two Maize Cultivars (Zea mays L.) under Deficit Irrigation Conditions"
    1- محمدحسن قدسی 2- مسعود اصفهانی 3- محمدمهدی طهرانی 4- علی اعلمی
    Journal of Crop Production and Processing, 2020
18. "Genetic diversity of Athelia rolfsii populations in the north of Iran"
    1- زهرا مهری 2- سيد اکبر خداپرست 3- علی اعلمی 4- صدیقه موسی نژاد
    -, 2020
19. "Rice Waste and Tillage Management in Guilan Rice Paddy Fields: An Essential Approach to Sustainable Agricultural Management"
    1- فاطمه علیپور 2- علی محمدی ترکاشوند 3- محمود شعبانپور 4- علی اعلمی
    International Journal of Agricultural Management and Development, 2020
20. "On-Tree water spray affects superficial scald severity and fruit quality in ‘Granny Smith’ apples"
    1- رقیه هدایتی 2- داود بخشی 3- نادر پيرمراديان 4- علی اعلمی
    Journal of Applied Horticulture, 2020
21. "Evaluation of percentage and degree of inulin polymerization and yield in 15 cultivars and accessions of chicory (Cichorium intybus L.) in northern plains of Iran"
    1- صادق پورمرادی 2- علی اعلمی 3- مسعود اصفهانی
    -, 2020
22. "Effect of fertilizer management and the application of zeolite on agronomic traits and grain yield of maize (Zea mays L.) hybrids under deficit irrigation conditions"
    1- محمدحسن قدسی 2- مسعود اصفهانی 3- محمدمهدی طهرانی 4- علی اعلمی
    Iran Agricultural Research, 2020
23. "Investigation of soybean advanced lines and parental varieties under non-stress and under water stress conditions"
    1- زبیده کهن پور 2- عاطفه صبوری 3- ابراهیم هزارجریبی 4- علی اعلمی
    Environmental Stresses in Crop Sciences, 2020
24. "Constructing Hordeum vulgare Protein- Protein Interaction Network Based on Interolog Method"
    1- ژاله حکمتی 2- علی اعلمی 3- جواد ظهیری
    Modares Journal of Biotechnology, 2019
25. "Assessing Aegilops tauschii genotypes to drought stress using tolerance indices"
    1- مهران فلکناز 2- علی اعلمی 3- علی اشرف مهرابی 4- عاطفه صبوری 5- دانیال کهریزی
    Cereal Research, 2019
26. "Pomological Attributes and Chemical Composition of Cultivars and Wild Genotypes of Pistachios (Pistacia vera L.) in Iran"
    1- محمد عارف پوریان 2- داود بخشی 3- حسین حکم آبادی 4- علی اعلمی
    Journal of Nuts, 2019
27. "Triterpenoid gene expression and phytochemical content in Iranian licorice under salinity stress"
    1- زهرا شیرازی 2- علی اعلمی 3- مسعود توحید فر 4- محمد مهدی سوهانی
    PROTOPLASMA, 2019
28. "Assessment of some morphological and physiological traits in Aegilops species under salt stress conditions"
    1- علی محمودی 2- علی اعلمی 3- ر بهشتی 4- مریم دانش گیلوایی
    Crop Breeding Journal, 2019
29. "ASSESSMENT OF GENETIC RELATIONSHIPS AMONG CULTIVATED AND WILD PISTACHIOS (PISTACIA VERA L.) USING MOLECULAR MARKERS"
    1- محمد عارف پوریان 2- داود بخشی 3- علی اعلمی 4- حسین حکم آبادی
    Journal of Horticultural Research, 2019
30. "Genetic engineering of lignin biosynthesis pathway improved stem bending disorder in cut gerbera (Gerbera jamesonii) flowers"
    1- حمیده جابریان همدان 2- محمد مهدی سوهانی 3- علی اعلمی 4- محمد جواد نظری دلجو
    Scientia Horticulturae, 2019
31. "Functional role of peroxidase gene in the resistance of the cut gerbera flower (Gerbera jamesonii) to stem bending disorder"
    1- حمیده جابریان 2- محمد مهدی سوهانی 3- علی اعلمی 4- محمد جواد نظری دلجو
    Journal of Plant Process and Function, 2019
32. "Cellular and physiological responses to drought stress in Aegilops tauschii genotypes"
    1- مهران فلکناز 2- علی اعلمی 3- علی اشرف مهرابی 4- عاطفه صبوری 5- دانیال کهریزی 6- ناصر کریمی
    Cellular and Molecular Biology, 2019
33. "Gene Delivery to Tobacco Root Cells with Single-Walled Carbon Nanotubes and Cell-Penetrating Fusogenic Peptides"
    1- آرزو گلستانی پور 2- مریم نیکخواه 3- علی اعلمی 4- سامان حسینخانی
    Molecular Biotechnology, 2018
34. "Evaluation of some rice cultivars based on pre-harvest sprouting resistance"
    1- سهیلا نیک زاده 2- علی اعلمی 3- مسعود اصفهانی 4- علی اکبر عبادی
    Iranian Journal of Field Crop Science, 2018
35. "The impact interaction of three different tillage methods and rice residual management on soil physical properties and rice growth"
    1- فاطمه علیپور 2- علی محمد ترکاشوند 3- محمود شعبانپور 4- علی اعلمی
    POLISH JOURNAL OF SOIL SCIENCE, 2018
36. "Effect of transplanting date on radiation interception and radiation use efficiency in rice (Oryza sativa L.) varieties"
    1- حاتم حاتمی 2- غلامرضا محسن آبادی 3- مسعود اصفهانی 4- بهمن امیری لاریجانی 5- علی اعلمی
    Cereal Research, 2018
37. "Assessment of NAC2, MYB and CBF14 genes expression in susceptible and resistance Aegilops to salinity"
    1- علی محمودی 2- علی اعلمی 3- سید حسن حسنی کومله 4- مسعود اصفهانی 5- رضا شيرزاديان خرم آباد
    Iranian journal of rangelands and forests plant breeding and genetics research, 2018
38. "Evaluation of genetic diversity in some of Iranian and foreign rice genetic resources based on morphological traits"
    1- حیدر عزیزی 2- علی اعلمی 3- مسعود اصفهانی 4- علی اکبر عبادی
    Applied Research in Field Crops, 2018
39. "Metabolic Engineering of Glycyrrhizin Pathway by Over Expression of Beta amyrin 11 Oxidase in Transgenic Roots of Glycyrrhiza glabra"
    1- زهرا شیرازی 2- علی اعلمی 3- مسعود توحیدفر 4- محمد مهدی سوهانی
    Molecular Biotechnology, 2018
40. "Responses of pomegranate cultivars to severe water stress and recovery: changes on antioxidant enzyme activities, gene expression patterns and water stress responsive metabolites"
    1- محمد پورقیومی 2- مجید راحمی 3- داود بخشی 4- علی اعلمی 5- علی اکبر کامگار حقیقی
    PHYSIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY OF PLANTS, 2017
41. "The physiological responses of various pomegranate cultivars todrought stress and recovery in order to screen for drought tolerance"
    1- محمد رضا پورقیومی 2- داود بخشی 3- مجید راحمی 4- علی اکبر کامگار حقیقی 5- علی اعلمی
    SCIENTIA HORTICULTURAE, 2017
42. "Effect of seed priming on lodging indices of rice (Oryza sativa L.) cultivars in direct seeding methods"
    1- حسن اخگری 2- مسعود اصفهانی 3- غلامرضا محسن آيادی 4- علی اعلمی
    Journal of Crop Production and Processing, 2017
43. "The Study of Genetic Diversity in Iranian Rice Cultivars using ISSR, IRAP and REMAP Markers"
    1- علی اعلمی 2- نوش آفرین کرمی
    Journal of Crop Breeding, 2017
44. "Effect of transplanting time on grain yield and physiological traits in grain filling period in rice cultivars"
    1- حاتم حاتمی 2- غلامرضا محسن آيادی 3- مسعود اصفهانی 4- بهمن امیری لاریجانی 5- علی اعلمی
    Journal of Crops Improvement, 2016
45. "The effect of planting method and nitrogen fertilizer on radiation efficiency, energy balance, soil characteristics and grain yield of wheat (Triticum aestivum L.)"
    1- محمدحسین ندیمی دفرازی 2- مسعود اصفهانی 3- غلامرضا محسن آبادی 4- علی اعلمی
    تحقیقات غلات, 2023
46. "Rescue of early cell death phenotype in Arabidopsis old3-1 mutant plants in short-day"
    1- مریم رجبی 2- مهدی یاراحمدی 3- رضا شيرزاديان خرم آباد 4- علی اعلمی 5- امین عابدی 6- محمدحسین رضادوست
    فرآیند و کارکرد گیاهی, 2023
47. "Effect of nitrogen fertilizer rates and mepiquat chloride application on lodging resistance indices and grain yield of rice (Oryza sativa L.cv. Hashemi)"
    1- مرصاد قناعتی گله پردسری 2- مسعود اصفهانی 3- علی اعلمی
    تحقیقات غلات, 2022
48. "Gene delivery to tobacco cells using single walled carbon nanotubes: a new generation of gene transfer vehicles"
    1- آرزو گلستانی پور 2- علی اعلمی 3- مریم نیکخواه 4- سامان حسین خانی
    زیست فناوری, 2021
49. "bioinformatics study and gene expression evaluation of Squalene Synthase 1 in Iranian native licorice"
    1- زهرا شیرازی 2- علی اعلمی 3- مسعود توحیدفر 4- محمد مهدی سوهانی
    مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی, 2017
50. "Association and structure analysis of some of rice (Oryza sativa L.) genetic resources based on microsatellite markers"
    1- حیدر عزیزی 2- علی اعلمی 3- مسعود اصفهانی 4- علی اکبر عبادی
    تحقیقات غلات, 2017

Conference Paper

1. "Identification of molecular markers associated with seed vigour index of rice using recombinant inbred line population"
   1- عباس صابري 2- عاطفه صبوری 3- امین عابدی 4- علی اعلمی
   چهارمين كنگره بين المللي و شانزدهمين كنگره ملي ژنتيك ايران,
2. "Genetic diversity in Athelia rolfsii by ISSR and SCoT markers"
   1- زهرا مهری 2- سيد اکبر خداپرست 3- علی اعلمی 4- صدیقه موسی نژاد
   چهارمین کنگره قارچ شناسی ایران,
3. "Study of Mycelial Compatibility Groups of Sclerotium rolfsii in north of Iran"
   1- زهرا مهری 2- سيد اکبر خداپرست 3- صدیقه موسی نژاد 4- علی اعلمی
   بیست و سومین کنگره گیاه پزشکی ایران,
4. "Comparision of advanced soybeans lines and parent varieties using AFLP markers"
   1- زبیده کهن پور 2- عاطفه صبوری 3- ابراهیم هزارجریبی 4- علی اعلمی 5- سامیه رئیسی
   نخستین همایش ملی تولیدات گیاهان زراعی و باغی,
5. "Effect of planting time on radiation use efficiency and grain yield of rice cultivars"
   1- زهرا آروند 2- مسعود اصفهانی 3- عاطفه صبوری 4- علی اعلمی
   دومین کنگره بین المللی و چهاردهمین کنگره ملی زراعت و اصلاح نباتات,
6. "Effect of seed priming to lodging characteristics and index of rice (Oryza sativa L.) cultivars"
   1- حسن اخگری 2- مسعود اصفهانی 3- غلامرضا محسن آيادی 4- علی اعلمی
   دومین کنگره بین المللی و چهاردهمین کنگره ملی زراعت و اصلاح نباتات,
7. "Effect of transplanting time on flag leaf dimensions and size and grain yield rice (Oryza sativa L.) cultivars in Roudbar region"
   1- محمدحسین ندیمی دفرازی 2- مسعود اصفهانی 3- علی اعلمی
   دومین کنگره بین المللی و چهاردهمین کنگره ملی زراعت و اصلاح نباتات,
8. "Effect of transplanting date on dry matter remobilization of six cultivars of rice"
   1- زهرا آروند 2- مسعود اصفهانی 3- عاطفه صبوری 4- علی اعلمی
   چهارمین کنفرانس ملی فیزیولوژی گیاهی ایران,
9. "Evaluation of phosphorus levels on dry matter remobilization, photosynthesis and yield components in two rice cultivars"
   1- محدثه وهاب زاده 2- مسعود اصفهانی 3- سیده ارحامه فلاح شمسی 4- سعید همتی 5- علی اعلمی
   اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ملی علوم زراعت و اصلاح نباتات و سومین همایش علوم و تکنولوژی بذر ایران,
10. "Effect of silicon fertilizer levels on dry matter remobilization and grain yield in rice cultivars"
    1- محدثه حیدری 2- مسعود اصفهانی 3- علی اعلمی
    اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ملی علوم زراعت و اصلاح نباتات و سومین همایش علوم و تکنولوژی بذر ایران,
11. "The Effects of transplanting date on the remobilization of dry matter and grain yield in rice (Oryza Sativa L.) Cultivars"
    1- محمدحسین ندیمی دفرازی 2- مسعود اصفهانی 3- علی اعلمی 4- فرناز فرجی
    اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ملی علوم زراعت و اصلاح نباتات و سومین همایش علوم و تکنولوژی بذر ایران,
12. "Effects of seed priming on grain yield and yield components in direct seeded rice (Oryza sativa L.)"
    1- حسن اخگری 2- مسعود اصفهانی 3- غلامرضا محسن آيادی 4- علی اعلمی
    اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ملی علوم زراعت و اصلاح نباتات و سومین همایش علوم و تکنولوژی بذر ایران,
13. "Evaluation of amylase enzyme activity and seed germination characteristics of native and improved varieties of rice."
    1- سهیلا نیک زاده 2- زیبا موسی پور 3- علی اعلمی 4- مسعود اصفهانی
    سومین کنفرانس ملی فیزیولوژی گیاهی ایران,
14. "Study on some anti oxidant enzyme activity in response to salicylic acid in rice"
    1- ژاله حکمتی 2- علی اعلمی 3- محمد مهدی سوهانی
    سومین کنفرانس ملی فیزیولوژی گیاهی ایران,
15. "Evaluation of rice genotypes (Oryza sativa L.) for tolerance of pre-harvest sprouting"
    1- ابراهيم شيرزادی لسکوکلايه 2- علی اعلمی 3- محمد مهدی سوهانی 4- مسعود اصفهانی 5- عاطفه صبوری
    سومين كنفرانس ملي فيزيولوژي گياهي ايران,
16. "Evaluation of some Rice cultivars for traits related to pre-harvest sprouting tolerance"
    1- زيبا موسی پور 2- سهيلا نيک زاده 3- علی اعلمی 4- مسعود اصفهانی 5- علی اکبر عبادی 6- مريم حسينی
    اولين كنگره بين المللي و سيزدهمين كنگره ملي علوم زراعت و اصلاح نباتات,
17. "Reduce damage by Egyptian broomrape (Orobanche aegyptica) in tomato plants with resistance induced by salicylic acid"
    1- محمد علی قاسمی 2- علی اعلمی 3- سيد علی الهی نيا 4- محمد مهدی سوهانی
    اولين كنگره بين المللي و سيزدهمين كنگره علوم زراعت و اصلاح نباتات,
18. "Screening of some wheat ancestors using specific markers linked to brown rust resistance genes in wheat"
    1- علی اعلمی 2- حيدر عزيزی
    اولين كنگره بين المللي و سيزدهمين كنگره ژنتيك ايران,
19. "Evaluation of morphological characteristics related to lodging in native and improved rice (Oryza sativa L.) cultivars"
    1- فرناز فرجی 2- مسعود اصفهانی 3- محمدرضا علیزاده 4- علی اعلمی
    اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ملی علوم زراعت و اصلاح نباتات و سومین همایش علوم و تکنولوژی بذر ایران,
20. "Effect of nonfunctional RON1 gene in Arabidopsis thaliana to dark –induced senescence"
    1- سمانه خشنود طوافی 2- رضا شيرزاديان خرم آباد 3- علی اعلمی
    همایش ملی یافته های پژوهش و فناوری در اکوسیستم های طبیعی و کشاورزی,